Walter Sutton estudiante de la Universidad de Columbia, trabajaba en una invetigacion acerca del proceso de meiosis en los espermatozoides del saltamontes, y observo que había similitudes entre el comportamiento de los cromosomas y lo que Mendel llamo factores.
Entonces se desconoció la función de los cromosomas, así que Sutton formulo la hipótesis de que estos eran los portadores de los factores, ahora llamados genes. Aunque no pudo comprobar que los genes están en los cromosomas, con las demostraciones de otros científicos se llego a la formulación de la teoría cromosomica de la herencia, que afirma que los cromosomas son los portadores de los genes. La teoría fue desarrollada de forma independiente en 1902 por Thodor Boveri y Walter Sutton.
Thomas Morgan realizo experimentos con la mosca de la fruta. Descubrió que las reglas de Mendel no se podían aplicar a la herencia de algunas características de este insecto. Las moscas de la fruta presenta tres pares de cromosomas homólogos y un par de cromosomas no idénticos que denomino heterocromosomas o cromosomas sexuales, responsables de determinar el sexo del organismo. Con ello llego a la conclusión de que los genes estaban en los cromosomas y que los que se encontraban en el mismo cromosoma tendían a heredarse juntos, por lo que los denomino genes ligados.
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